肺囊肿是由胚胎发育时期发生了发育障碍，引起的一个先天性的疾病。主要分为支气管源性囊肿和肺实质性囊肿。在胚胎发育时期，由原肠发生的肺牙，逐渐发展形成支气管树和肺泡，在发育初期是条索状组织，逐渐演变成管状。如果胚胎发育发生障碍，索条状结构不能演变成管状，远端的支气管，原始支气管组织于近端组织脱离，逐渐形成盲管，管腔内的分泌物不能排出，急剧膨胀，就形成了含粘液的囊肿。