发烧只是一个症状，证明身体内有炎症，但是如果感染是因为神经系统的炎症导致的话，那么因为这个炎症本身会损伤，脑组织会出现神经系统的后遗症，而不是因为发热烧坏的脑子，发烧39度3属于高热，建议应该是及时退热，如果婴儿比较小的话，如此高的温度还会导致出现热惊厥，应该及时到医院去就诊，在医生的帮助下给予退热治疗，同时积极完善相关的病因检查，并针对病因进行治疗。