卵巢囊肿对于月经周期会有一定的影响。因为卵巢囊肿本身是由于内分泌紊乱引起的，导致卵巢功能异常。一般小于五厘米的卵巢囊肿，也称为黄体囊肿，随着月经周期的恢复正常，会自动消失。但是如果超过五厘米的话，首先要排除恶性肿瘤的可能性，如果不存在恶变的话，应该尽早采取药物治疗或者是手术治疗，比如选择桂枝茯苓丸和金刚藤，或者是腹腔镜手术摘除。