先天性脑囊肿是一种良性病变，一般不会发生恶变，在囊肿很小的时候不会产生什么危害的，只需动态观察，定期复查头颅CT观察囊肿的大小情况即可，但是当囊肿增大，会引起颅脑组织压迫症状，如颅内压升高、恶心、呕吐、癫痫等症状则需要手术处理了，具体手术方案还要看囊肿的位置、大小，压迫情况来制定。一般药物治疗不会有什么好的效果。