肛门尖锐湿疣可表现为肛周出现单个或多个针头至黄豆大小的丘疹，呈淡红色，扁平或半球形，表面有光泽，质软，无症状。皮损逐渐增大增多，大小不等，外形多种多样，表面粗燥呈灰白色或粉红色。病程较长的尖锐湿疣表面角化明显，呈褐色，质地硬。因肛周皮肤更为湿润，并且经常受到排便摩擦或浸渍，尖锐湿疣可以发生糜烂、破溃而渗血或有脓性血痂覆盖。肛门皱襞间有分泌物积存、恶臭，如并发感染可出现瘙痒、压痛及疼痛感。巨大型损害又称巨大型尖锐湿疣，表现为生长迅速形成疣状或菜花状，可发生坏死感染，形态似癌，但病理为良性。肛管上段、直肠下段的尖锐湿疣不易发现，体积较大时患者他有肛门下坠感和疼痛，大便次数增多等表现。