儿童甲型流感早期症状和普通的流感相似，包括发热，咳嗽，咽痛，身体疼痛，头痛，发冷和疲劳等。有些患儿还会出现腹泻，呕吐，肌肉疼痛或者是疲倦，眼球充血疼痛。部分患儿病情可以迅速的进展，甚至继发有严重的肺炎，急性呼吸窘迫综合征，肺出血，胸腔积液，全血细胞减少，肾功能衰竭，败血症，休克，呼吸衰竭以及多器官功能损伤，会出现相应的比较明显的临床症状比如剧烈的咳嗽，咳痰，胸闷，咯血，精神萎靡甚至昏迷，严重的会危及生命。