褐色的分泌物可能来源于阴道，或者来源于宫颈、子宫。这些部位的出血量不多，具体原因可能是阴道壁的炎症，也可能是宫颈的病变，比如宫颈的息肉、宫颈的上皮内瘤病变或者宫颈的子宫宫颈癌。
如果宫腔的出血是发生在怀孕期间，就有可能是先兆流产、难免流产，以及先兆早产、临产的情况。如果是子宫、附件的原因，以及器质性病变，可能由子宫内膜息肉、子宫内膜癌所导致。子宫肌瘤也会引起月经过多的情况，月经延长。如果是卵巢的肿瘤或者卵巢的囊肿也会导致子宫发生异常出血，也会出现少量的褐色分泌物。