颅咽管瘤术后主要并发症包括尿崩症，水电解质紊乱，中枢性高热，下丘脑垂体，肾上腺轴内分泌紊乱，癫痫，应激性溃疡和视野障碍等。如果狼液溢出，刺激食管膜或脑膜，还可以引起无菌性脑膜炎，因此要严格执行专为颅咽管瘤制定的术后监测并及时处理。除此之外，肿瘤术后要警惕，肿瘤复发可能性，有研究表明，肿瘤全切或次全切术后加以放射治疗，肿瘤复发率为20%。患者10年生存率可达85%以上。手术方式，病理类型，肿瘤的大小和所生长的部位，以及术后有无联合放射治疗等综合治疗，并发症等均可影响颅咽管瘤的预后。