重症肌无力是一种获得性自身免疫性疾病，目前的研究结果表明，其发病机制主要是体内产生的一些胆碱受体抗体与突触后膜的乙酰胆碱受体产生了免疫反应，使乙酰胆碱受体受到破坏，从而使神经肌肉接头到传递功能发生障碍，从而引起一系列临床症状，但是引起重症肌无力免疫反应的原因目前不是很清楚，因为几乎所有的重症肌无力患者都有胸腺的异常，所以推算引起这种免疫反应可能与胸腺有关。