肛肠囊肿也就是我们常说的肛周脓肿这种情况下，在临床绝大部分是由于肛腺感染所造成的，肛腺多开口于肛窦位于内外括约肌之间，因为肛窦开口向上成为口袋状，以容易存留粪便，引起肛窦炎,而感染如果延至肛腺后可以导致括约肌间感染,另外肛周脓肿也可以继发于肛周皮肤的感染损伤，肛裂，内痔,药物注射,骶尾骨，骨髓炎等克罗恩病，溃疡性结肠炎或者某些血液病的病人，也容易发生肛周脓肿的情况