生殖器疱疹的治疗主要是抗病毒治疗，治疗的主要的目的是缓解症状，减轻疼痛，缩短病程，以及防治一些继发性的感染。要保持局部的干净和卫生保持干燥的一个状态，每天可以用等渗的生理盐水清洗，如果明显疼痛的话，可以口服一些止痛的药物，如果合并细菌感染的话，可以用一些百多邦乳膏，规范的抗病毒治疗是关键，可以规范的口服阿昔洛韦，或者是伐昔洛韦。