强迫症的发病机制目前尚未完全阐述清楚。目前，学者们和临床医生认为强迫症发病与遗传、神经生物学因素、心理学因素等都有关系。有研究显示，强迫症有家族聚集性，荟萃分析表明患者的一级亲属有较高的患病率。有不少证据支持强迫症患者5-羟色胺功能异常，氯米帕明或氟西丁等具有5-HT再摄取的药物治疗强迫症也是有效的也佐证了强迫症发病与5-HT功能异常有关。