生殖器疱疹的病程较长，而且会经常出现反复发作，其治疗需要一个很长的过程。首先是初步治疗生殖器疱疹患者的病情发作后，需要及时进行抗病毒治疗，使症状得到缓解，如果患者患病部位的皮肤溃疡长时间不能治愈，需要进行持续的用药治疗，直到溃疡愈合。再者就是抑制治疗，如果患者经常出现症状的反复发作现象，则需要长时间使用抗病毒药物进行抑制治疗，对于一年中症状反复发作出现六次以上的患者，可以使用抑制治疗，降低复发率。还有是间歇性治疗，患者要随身携带抗病毒药物，以便在疾病复发的时候是症状得到及时的控制。