系统性红斑狼疮的病因很复杂，它是结缔组织病的典型代表，具有多种自身抗体，包括已知抗体和未知抗体，造成多脏器多系统的损害，其中研究发现遗传因素与疾病的发作有一定的关系，证实系统性红斑狼疮是多基因相关的疾病。环境因素中的紫外线可以诱发皮肤上皮细胞凋亡新抗原暴露而成为自身抗原，药物，化学试剂，微生物等也可诱发疾病。雌激素也占有一定的作用，这也是说明女性患者明显多于男性患者的原因。