甲胎蛋白是胎儿期由卵黄囊肝，胃肠道产生的一种球蛋白，肝癌以及恶性畸胎瘤的患者均可以明显的升高，而癌胚抗原是胎儿胃肠道产生的一种糖蛋白，在结肠癌，胃癌，肺癌，乳腺癌均可以明显的升高。肝癌术后监测甲胎蛋白，结直肠癌术后监测癌胚抗原对于预测复发有较好的作用。但是甲胎蛋白和癌胚抗原升高不一定存在癌症。一些正常的生理状态和良性的疾病也可以引起这些指标的升高，比如说妊娠和病毒性肝炎，肝硬化可以造成甲胎蛋白的升高，而吸烟，糖尿病，直肠息肉，胰腺炎，结肠炎也可以造成癌胚抗原的升高