会厌囊肿的手术其实没有太大痛苦，因为最常用的手术方式是通过全麻支撑喉镜下手术治疗。手术也比较简单，不是特别复杂的，一般半个小时就可以做好的，即使做全麻也没有太大的影响的。手术后多少可能会有一点疼痛的，大部分人都可以耐受的，如果是无法忍受的话，也是可以适当的用止痛药的，一般一周到两周左右时间都会逐渐恢复的，这个手术前很常见，也不用特别担心的。