引起角膜炎的病因比较复杂（不同类型的角膜炎病因不同）。最常见的是细菌、病毒、真菌等病原微生物引起的感染性角膜炎（其中细菌是感染性角膜炎的主要原因）。另外，一些自身免疫性疾病（如类风湿性关节炎）及某些全身病（如糖尿病、艾滋病、营养不良等）可以引起内源性角膜炎；邻近组织（如结膜、巩膜、虹膜等）的炎症，有时也会曼延到角膜导致角膜炎。