生殖器疱疹的危害，主要表现在如下几个方面：生殖器疱疹可引起播散性疱疹，疱疹性脑膜炎，前列腺炎，直肠炎，盆腔炎，脊髓神经根疾病。生殖器疱疹还可以引起人工流产后不孕症以及男性不育症。生殖器疱疹还可以引起子宫内的感染和新生儿的感染。生殖器疱疹常与其他性传播疾病，比如淋病，非淋球菌性尿道炎，梅毒，尖锐湿疣，阴道念珠菌病，滴虫等混合感染。