临床上引起胆总管进食的原因有很多，有的胆总管结石是由于其他部位的结石下行导致的，最常见的是胆囊结石，主要的的成分是胆固醇。大多数的胆总管结石还是胆总管原发性的结石，主要和胆道感染，胆道梗阻，胆道蛔虫，华支睾吸虫死亡的虫体或者虫卵，胆肠吻合术后缝线线结，食物残渣等有着密切的关系。其主要的成分是胆色素或者以胆色素为主的混合型结石。