手足口病可以引起多系统的并发症，神经系统和心血管系统的并发症最常见、最严重。出现神经系统并发症可以有剧烈呕吐，哭闹或烦躁不安，夜惊或者精神差，表情淡漠，性情改变，不自主肢体抖动，四肢无力甚至瘫痪，眼球震颤等。出现心血管系统并发症可以有面色苍白，四肢末梢凉，肢体水肿等表现。还可以出现肺水肿，肺出血的并发症表现为口吐粉红色泡沫痰，呼吸浅快等。