手术都有其风险性，鼻中隔偏曲手术，虽然创伤较小，手术时间不长，但也有其一定的风险性。一些常规的风险，包括感染，出血及麻醉的风险。鼻中隔矫正手术，较为特征性的手术风险包括：其一是鼻中隔血肿，如果术中鼻中隔两侧的粘软骨膜，在矫正后不能紧密贴合，两侧鼻腔填塞不均匀，术后即容易出现鼻中隔血肿。其二是鼻中隔脓肿，常继发于鼻中隔血肿感染后出现。故而术后要足量的使用广谱抗生素预防感染。第三是鼻中隔穿孔，鼻中隔穿孔的发生，和术中手术的操作以及局部的感染都有一定关联。可以二期进行，鼻中隔穿孔修补手术。