任何疾病都具有潜伏期，手足口病也不例外，患儿感染手足口病后，病毒进入体内遵循侵袭，繁殖，增生，表达等过程，在这个过程中，当毒素的量和病毒的数量不能引起机体反应时，患者是不会表现出来临床发病的状态，也就称之为潜伏期。2018版手足口病诊疗指南指出手足口病的潜伏期多为2至10天左右，平均为3-5天。在这个过程中，患儿没有临床表现。一旦机体不能自身消灭病毒，该病毒就会出现表达，也就是进入了临床期。