婴幼儿如果不是因为细菌或者病毒感染而导致消化不良，是不影响注射疫苗的。由于婴幼儿的胃肠道功能很弱，肠胃蠕动比较慢，肠道内的正常菌群没有完全的建立，加上饮食结构的不合理性，因此很容易出现消化不良的症状。由于细菌或病毒的感染，导致胃肠道粘膜的炎症，也会引起消化不良的症状。可服用益生菌，或者顺时针按摩宝宝的腹部，增加胃肠道的蠕动，都能够很好缓解消化不良症状。