怀孕35天药流不一定能流干净。药物流产和负压吸宫术相比对人体的损伤会略小一些，但是，药物流产有流产失败，流产不完全，流血时间长和流血多的可能性，所以药物流产后一定要复查超声。如果孕囊没有排出来，应该行负压吸宫术。如果宫腔内有残留，可能需要清宫。如果子宫收缩不良的话，可以肌肉注射缩宫素，或者口服促进子宫收缩的药物，比如益母草颗粒或者新生化胶囊。