小儿原发性脑干损伤最主要的原因就是外伤引起的，当然对于新生儿来说产伤也是有可能出现的，由于脑移位或者是脑疝引起压迫性的损伤、弥漫性脑肿胀。主要的临床表现就是出现意识障碍多在受伤以后进入持续性的昏迷。生命体征的不稳定，有可能会出现不规则的呼吸或者抽泣一样的呼吸，这是由于呼吸中枢受到损伤引起的。眼球运动和瞳孔的改变，这是由于中脑的动眼神经核和脑桥的展神经核受到损伤引起的。另外还有可能出现锥体束的阳性，去大脑强直状态。这个疾病多数情况下是不需要手术治疗的，维持生命体征的平稳，内环境的稳定，减轻脑细胞的水肿，可以使用强力的脱水药物来进行治疗，如果出现了抽搐的情况或者说烦躁不安，可以给予对症处理的。