利巴韦林颗粒最主要的副作用是溶血性贫血，在口服治疗后最初的1-2周内，会出现血红蛋白的下降。利巴韦林颗粒在使用中还会出现全身的不良反应，主要有疲倦，头痛，身体虚弱乏力，胸痛，寒战，发热等症状，神经系统症状主要是眩晕，消化系统症状有食欲减退，胃部不适，恶心呕吐，轻度腹泻，便秘，消化不良，肌肉，骨骼系统可出现肌肉痛，关节疼痛等。