肾单位是由肾小球和肾小管组成的。肾小球具有滤过功能，滤过毒素，滤过水；而肾小管主要是负责吸收水分，吸收滤过的东西。对于肾囊肿，主要是由于肾小球囊到下面的集合系统之间的任何一个部分出现扩张。当扩张直径达到几个毫米的时候，就会和原来的肾小球分离，形成一个独立的、充满液体的囊腔。囊腔越来越大，就会形成肾囊肿。肾囊肿局部血管破裂出血或者炎症刺激，导致钙沉积，就形成了肾囊肿钙化。