米非司酮的副作用有：恶心，乏力，腹胀，下腹痛，头晕，乳头胀，呕吐等。一般发生率比较低，症状较轻微，不需要处理的。米非司酮是配合米索前列醇来进行药物流产的。停经49天之内的患者可以选择药流。停经70天之内的可以选择人工流产。临床上大部分人是服用完米索前列醇后孕囊排出，也有个别患者服用米非司酮后孕囊就排出。用药期间会出现药流不全的情况，腹痛厉害，或是阴道出血比月经量多，需要妇科检查，必要的时候直接清宫治疗。