任何药物均有治疗作用和副作用，但药物总是利大于弊，才能在临床中广泛应用。抗疲劳眼药水中若含有类固醇激素，长时间使用可以造成眼压升高，严重影响视力；另外眼药水中若含有防腐剂，长时间应用，会对角膜上皮造成损害，导致干眼症；此外长时间应用，还可以形成药物的依赖性以及产生耐药性，以上均为抗疲劳眼药水的副作用，当然短期内使用，其副作用还是很少的。