三个月宝宝睡觉摇头可以从以下三方面来考虑：一、属于正常现象，宝宝一般在睡前吃奶的时候，感到舒服，开心或者有足够安全感的时候，会出现摇头现象，无需处理，观察即可。二、维生素D缺乏性佝偻病，在睡觉的时候容易出现多汗，汗液对枕后部皮肤造成刺激，会出现摇头现象，可以对症给予维生素D和葡萄糖酸钙口服治疗。三、头后部局部皮肤有皮疹，伴有痒感，可以找医生给予对症的处理。