人类总共有12对脑神经，能够发生脑神经疼痛的，主要是三叉神经，和舌咽神经，其中三叉神经，又分为原发性三叉神经痛和继发性三叉神经痛。原发性三叉神经痛是指三叉神经从脑干发出来的这一部分，还没得及形成神经鞘保护，受到附近小动脉搏动的骚扰，而引起三叉神经疼痛；继发性三叉神经痛，是因为三叉神经走行的区域内有肿瘤存在刺激到了三叉神经；舌咽神经痛是因为舌咽神经发出来的这一部分受到动脉搏动刺激骚扰。