肛周脓肿形成后大多都需要手术治疗，手术方式分切开引流术和根治术两类，以肛周脓肿根治术为例，术后恢复愈合时间长短与脓肿波及范围、位置有关。一般低位皮下间隙脓肿，术后伤面愈合一般需要3--4周；坐骨直肠间隙脓肿，需要切开，必要时挂线，恢复时间会在一个月到一个半月左右；如果脓肿波及范围较大，直接切开术后愈合时间长，也可以开窗留桥，缩短愈合时间。