小脑囊肿的治疗需要根据囊肿的大小、位置、及脑周围组织的关系来评估以决定治疗方式。治疗方式一般分为保守治疗与手术治疗两种，当脑囊肿很小的时候，可以没有任何症状，可暂给予动态观察，定期复检即可。当囊肿增大引起脑组织压迫症状，如头痛、恶心、呕吐等颅内压增高症状，保守治疗给予20%的甘露醇降颅压。最根本的解决办法是去除病因，给予手术切除囊肿治疗。