肛周脓肿按照发病的位置通常分为五类，左右两侧坐骨直肠间隙脓肿，左右两次骨盆直肠间隙脓肿，和直肠后间隙脓肿。肛提肌以下两侧坐骨结节直接的脓肿成为坐骨直肠间隙脓肿，肛提肌以上，腹膜反折以下直肠壁外侧间隙发生感染成为骨盆直肠间隙脓肿，直肠后骶骨前间隙，成为直肠后间隙脓肿。还有一些其他部位脓肿如肛周皮下脓肿，括约肌间隙脓肿，直肠粘膜下脓肿等。