月经第三天是不可以做阴超的。在月经期，子宫颈呈微张状态，可使经血排出，如果此时做阴式超声检查容易细菌感染，而引发子宫内膜炎；由于经血中含有脱落的子宫内膜，此时进行阴道内的操作，容易将月经血挤入盆腔，引发子宫内膜异位症，进而继发不孕。此外，在月经期做阴超检查，也影响检查结果。所以在做超声检查时应避开月经期，必须做检查时建议选择腹式超声。