急性扁桃体炎，尤其是化脓性扁桃体炎，致病菌大多数是由于乙型溶血性链球菌、肺炎双球菌或者是流感病毒、鼻病毒等引起来。治疗原则上根据分泌物培养和药敏试验，选择敏感药物治疗。在培养结果出来以前，多是经验性的选择药物治疗。对于细菌性引起来的，一般常选择青霉素类的或者是头孢霉素类；病毒性的应该选择利巴韦林等抗病毒的药物。