水样腹泻主要是由于肠粘膜分泌旺盛、吸收障碍以及肠蠕动过快所引起的。夏季水样腹泻主要是由于细菌感染所造成的，而秋季腹泻都是由于轮状病毒感染所导致的。此外急性中毒、霍乱、伤寒、甲状腺危象、过敏性紫癜、结直肠癌、溃疡性结肠炎、类癌综合征、小肠恶性淋巴瘤、肾上腺功能减退危象等变态反应性疾病、内分泌疾病和消化道恶性肿瘤也可引起，还需要根据伴随症状、大便的性状以及有无异味来判断具体的疾病。