心脏杂音的危害取决于患者心脏结构的异常、疾病的严重程度、临床症状以及合并的基础疾病。如果患者是一个单纯的房间隔缺损、室间隔缺损或动脉导管未闭患者，这类患者及早的行介入封堵或手术修补彻底纠正心脏结构的异常，患者远期预后良好，一般不会影响患者的寿命。如果患者是二尖瓣或主动脉瓣区明显的杂音，平时又合并活动时心慌、胸闷、憋喘、气短、全身浮肿等心衰的症状，这类患者具有一定的临床危害，预后不佳，随时可能出现急性左心衰、恶性心律失常及心源性猝死的风险。