药流的最佳时间通常是在停经40到45天，这时候孕囊比较小，而且又大于一公分以上。所以药流的时候比较容易排出孕囊，同时在孕囊排出以后又比较容易进行辨别。通常在这时候就可以去医院妇科检查彩超确诊宫内孕，然后做白带常规、血常规、凝血以及肝肾功能检查，没有异常的情况下就可以开始服用米非司酮，以及米索前列醇来进行药物流产。