凌晨咳嗽厉害，首先需要考虑的是咳嗽变异性哮喘引起的，咳嗽变异性哮喘的典型表现就是发作性干咳，常发生在半夜或者凌晨。治疗上主要以吸入性糖皮质激素为首选，比如布地奈德，如果患者伴有呼吸困难等可以配合支气管舒张剂，如氨茶碱治疗。如果有感染的证据，可以加用抗生素，如阿莫西林等联合治疗。当然还有一些其他疾病也可以引起，如气管炎、肺瘀血，如果治疗后患者没有好转，建议到医院详细检查，对症治疗。