激光治疗痣疗法具有高度的选择性，能识别正常的皮肤，所以它能非常顺利地穿透病损上正常皮肤，直接作用于黑素细胞内的黑素小体，并导致黑素细胞破碎，破裂的细胞及黑素体等被吞噬细胞吞噬，经淋巴系统转运，后经肾脏排出。由于激光的波长极纯，无黑素的正常组织吸收极少，极短的脉宽保证了周围正常皮肤不受损伤。

激光治疗是非侵入性的，基本不会损伤皮肤，治疗过程是利用激光在瞬间爆发巨大能量作用于色素组织，使色素击碎，分解，被巨噬细胞吞噬掉，随淋巴循环排出体外，达到祛除色素的目的。其突出的优势是治疗可不经局部麻醉、在数分钟至数十分钟的时间内完成一次治疗，操作十分方便。