遗传因素：大约有20%左右唇腭裂患儿可查询出有遗传史;孕期感染：怀孕初期(2个月左右)的母亲感染过病毒，如流感、风疹、弓形体病等;慢性疾病影响：母体怀孕期间患有如贫血、糖尿病等慢性疾病;怀孕期间服用某些药物：如镇静药、抗癫痫药、抗恶性肿瘤药、肾上腺皮质激素、抗惊厥药等;怀孕期间母体接受过大剂量X线、放射性照射;妊娠早期的营养缺乏(怀孕期间母体缺乏钙、磷、铁和维生素B、维生素C、维生素D等)可能是发病诱因之一。