局部的不良反应主要包括咬肌过度无力及因肉毒素向临近肌肉组织扩散而引起的相应表现，注入肉毒素后。而这些临床表现与注射部位和注射肉毒素的剂量有关。个别病人发现注射肉毒素以后有发热、不适、疲劳，一般这些临床表现为一过性的并在数周内自行消失。肉毒杆菌毒素注射后一般效果可以维持一年左右，然后有复发可能，但是可以再次注射。