在治疗的初始阶段，牙髓中会发生轻微和暂时的炎症反应。患者在施加压力的头几天会有疼痛或不适，但不要担心，疼痛会在几天后消失。在正畸治疗过程中，牙根表面也经历吸收和增殖的重建活动。治疗后，牙根恢复正常，具有自身的修复能力，但如果在治疗过程中施加过大的应力，牙根吸收的风险将会增加。然而，在牙齿被矫正到正常位置并停止移动后，通过牙周膜自身的修复能力，牙齿可以通过牙周膜的再附着而稳定下来，而不会受到长期损伤。