做根管治疗一般不会太痛苦,有脓的话应该是牙髓已经坏死发展到牙根尖而且是比较严重的阶段了。现在多采取根管治疗,治疗一般需要就诊三次左右,每一次的治疗都不相同,您的治疗如果没有封闭开髓孔,应该是为了开放或引流,所放的棉球是为了阻止食物嵌塞入洞,压迫髓腔,不建议将棉球取下。