自体脂肪填充很可能会引起人身体的排异反应，而导致人体出现免疫系统功能的障碍，出现免疫系统的疾病，这是自体脂肪填充可能引起的最严重的并发症。其次自体脂肪填充还可能会引起感染，如果不能及时的处理或者是正确的治疗，就可能会引起败血症，这个时候会引起全身脏器的衰竭。
