卵巢囊肿并不是一种疾病，而是一类疾病的总称。包括了卵巢瘤样病变和卵巢肿瘤。卵巢瘤样病变有包括黄体囊肿，滤泡囊肿，黄素化卵泡膜囊肿，子宫内膜异位囊肿等。卵巢肿瘤一般是指囊性浆液性囊腺瘤，黏液性囊腺瘤等，还源于生殖细胞的卵巢成熟畸胎瘤。从以上描述可以看出，子宫内膜异位囊肿，也就是巧克力囊肿其实是属于卵巢囊肿的一种。