根管消毒,通过物理和化学(药物)方法彻底消除根管内的残余感染。消毒药物置入髓室或根管后,应封闭5~7天,待其充分起效,复诊时若无症状则可进行第三步即根管充填。如复诊时仍有症状或根管内仍与较多分泌物,则不宜充填根管,需再行根管消毒,以免充填后发生炎症反应。